M.F.Axundzadə adına mədəniyyət mərkəzi 1965 - ci ildən mədəniyyət evi kimi fəaliyyətə başlamışdır.
Azərbaycan Respublikası Mədəniyyət və Turizm Nazirinin 27 dekabr 2012 - ci il tarixli, 654 nömrəli əmrinə və Şəki Şəhər İcra Hakimiyyətinin 1/ 1947 nömrəli 13 noyabr 2012 - ci il tarixli məktubuna əsasən 07 yanvar 2013 - cü il tarixdən M.F.Axundov adına mərkəzi mədəniyyət evinin adı M.F.Axundzadə adına şəhər Mədəniyyət Mərkəzi adlandırılmışdır.

Mədəniyyət mərkəzinin aşağıdakı filialları vardır:

S.Vurğun adına şəhər folklor evi 
Ə.Abdullayev adına şəhər diyarşünaslıq evi
Ü.Hacıbəyov adına şəhər folklor evi
M.K.Hacıoğlu adına şəhər sənətkarlıq evi
B.Axundov adına şəhər folklor evi 
V.İbrahim adına şəhər folklor evi 
M.İsmayılov adına şəhər diyarşünaslıq evi
N.Bədəlov adına şəhər folklor evi 
L.Abdullayev adına şəhər diyarşünaslıq klubu
M.Nəsrullayev adına şəhər sənətkarlıq klubu 
M.S.Əliyev adına şəhər diyarşünaslıq klubu 
Y.Məmmədov adına şəhər diyarşünaslıq klubu 
İ.Salmanov adına şəhər folklor klubu 
Ə.Şəkili adına şəhər diyarşünaslıq klubu 
R.Sadıqov adına şəhər diyarşünaslıq klubu 
B.Ələsgərova adına şəhər folklor klubu 
K.Kərimov adına şəhər folklor klubu 
Ə.Sadıqov adına şəhər diyarşünaslıq klubu 
İ.Osmanlı adına Kiş kənd folklor evi 
Oxud kənd folklor evi 
Qoxmuq kənd folklor evi 
Birinci Biləcik kənd folklor evi 
Baltalı kənd diyarşünaslıq evi 
Baş Göynük kənd sənətkarliq evi 
Aşağı Göynük kənd diyarşünaslıq evi 
Baş Layısqı kənd folklor evi 
Cumakənd folklor evi
Baş Zəyzid kənd sənətkarliq evi 
Baş Küngüt kənd diyarşünaslıq evi 
Aşağı Küngüt kənd diyarşünaslıq evi 
Bideyiz kənd folklor evi 
Qayabaşı kənd diyarşünaslıq evi 
Şəki kənd folklor evi 
Suçma kənd diyarşünaslıq evi 
Aydınbulaq kənd diyarşünaslıq evi
Şorsu kənd folklor evi 
Oravan kənd folklor evi 
Kiçik Dəhnə kənd diyarşünaslıq klubu
Köbər Zəyzid kənd folklor klubu 
Qaratorpaq kənd folklor klubu 
Sarıca kənd diyarşünaslıq klubu 
Cəyirli kənd folklor klubu 
Aşağı Daşağıl kənd folklor klubu 
Böyük Dəhnə kənd folklor klubu 
Cəfərabad kənd diyarşünaslıq klubu 
İbrahimkənd diyarşünaslıq klubu 
Çeşməli kənd diyarşünaslıq klubu 
Daşbulaq kənd diyarşünaslıq klubu 
Baş Şabalıd kənd diyarşünaslıq klubu 
Öryət kənd diyarşünaslıq klubu 
Qırxbulaq kənd folklor klubu 
Çapağan kənd folklor klubu 
Qudula kənd folklor klubu 
Qaradağlı kənd diyarşünaslıq klubu 
Turan qəsəbə folklor klubu 
Dərəcənnət kənd folklor klubu 
Qumux kənd folklor klubu 
İkinci Biləcik kənd diyarşünaslıq klubu 
Göybulaq kənd folklor klubu 
Fazıl kənd diyarşünaslıq klubu 
Cunud kənd folklor klubu 
Babaratma kənd diyarşünaslıq klubu 
Təpəcənnət kənd diyarşünaslıq klubu 
İnçə-Zunud kənd folklor klubu 
Aşağı Şabalıd kənd folklor klubu 
Şin kənd folklor klubu 
Çayqaraqoyunlu kənd diyarşünaslıq klubu 
Bolludərə kənd diyarşünaslıq klubu

Mərkəzin direktor əvəzi: Cəlilov Aqaəli Mürsəl oğlu